Améliorer la gestion, la restauration et la conservation des milieux naturels composant les trames de continuités écologiques et la circulation des espèces.
Il vise à réduire les disparités et renforcer l'attractivité du territoire en finançant des projets collaboratifs entre les différents pays de la zone.
Les missions définies dans le plan de gestion sont d'ordre scientifiques et techniques, administratives ou liées à la communication et l'information du public
La réserve naturelle régionale de la Côte de Mancy revêt un caractère remarquable en Bourgogne-Franche-Comté de part son intérêt faunistique et floristique.